Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk2Q3U5Q7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmpk2Q3U5Q7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk2Q3U5Q7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmpk2Q3U5Q7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmpk2Q3U5Q7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmpk2Q3U5Q7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms