Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc17a7Q3TXX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc17a7Q3TXX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc17a7Q3TXX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc17a7Q3TXX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc17a7Q3TXX4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc17a7Q3TXX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms