Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,71■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Riiad1Q3KNY5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Riiad1Q3KNY5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Riiad1Q3KNY5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Riiad1Q3KNY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Riiad1Q3KNY5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Riiad1Q3KNY5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Riiad1Q3KNY5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,6 ms