Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2-M3Q31093 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2-M3Q31093 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2-M3Q31093 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-M3Q31093 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-M3Q31093 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M3Q31093 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms