Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q149G0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q149G0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q149G0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q149G0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q149G0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q149G0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q149G0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q149G0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q149G0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q149G0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q149G0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q149G0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q149G0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q149G0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q149G0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Q149G0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q149G0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q149G0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q149G0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q149G0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q149G0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q149G0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q149G0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q149G0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q149G0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q149G0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q149G0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q149G0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q149G0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q149G0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q149G0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q149G0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q149G0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q149G0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q149G0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q149G0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q149G0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q149G0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q149G0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q149G0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q149G0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q149G0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q149G0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q149G0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q149G0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q149G0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q149G0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q149G0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q149G0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q149G0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q149G0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q149G0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q149G0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q149G0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q149G0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q149G0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q149G0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q149G0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q149G0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q149G0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q149G0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q149G0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q149G0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q149G0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q149G0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q149G0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q149G0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q149G0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q149G0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q149G0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q149G0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q149G0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q149G0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q149G0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q149G0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q149G0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms