Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms