Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif3aQ0VBL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif3aQ0VBL6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif3aQ0VBL6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif3aQ0VBL6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hif3aQ0VBL6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hif3aQ0VBL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hif3aQ0VBL6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms