Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Kndc1Q0KK55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Kndc1Q0KK55 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Kndc1Q0KK55 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Kndc1Q0KK55 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Kndc1Q0KK55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Kndc1Q0KK55 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Kndc1Q0KK55 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Kndc1Q0KK55 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kndc1Q0KK55 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kndc1Q0KK55 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kndc1Q0KK55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kndc1Q0KK55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Kndc1Q0KK55 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kndc1Q0KK55 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kndc1Q0KK55 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Kndc1Q0KK55 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kndc1Q0KK55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms