Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gata4Q08369 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gata4Q08369 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gata4Q08369 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gata4Q08369 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gata4Q08369 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms