Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox10Q04888 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sox10Q04888 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sox10Q04888 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sox10Q04888 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sox10Q04888 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sox10Q04888 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms