Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl1Q02067 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ascl1Q02067 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl1Q02067 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl1Q02067 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl1Q02067 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl1Q02067 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms