Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbp4Q00724 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp4Q00724 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp4Q00724 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp4Q00724 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp4Q00724 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms