Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IhhP97812 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IhhP97812 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IhhP97812 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IhhP97812 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IhhP97812 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IhhP97812 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IhhP97812 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IhhP97812 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IhhP97812 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IhhP97812 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IhhP97812 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IhhP97812 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IhhP97812 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IhhP97812 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IhhP97812 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IhhP97812 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
IhhP97812 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IhhP97812 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IhhP97812 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IhhP97812 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IhhP97812 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IhhP97812 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IhhP97812 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IhhP97812 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IhhP97812 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IhhP97812 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IhhP97812 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IhhP97812 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IhhP97812 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IhhP97812 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IhhP97812 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IhhP97812 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IhhP97812 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IhhP97812 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IhhP97812 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IhhP97812 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IhhP97812 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IhhP97812 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IhhP97812 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IhhP97812 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IhhP97812 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IhhP97812 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IhhP97812 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IhhP97812 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IhhP97812 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IhhP97812 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IhhP97812 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IhhP97812 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IhhP97812 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IhhP97812 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IhhP97812 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IhhP97812 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IhhP97812 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IhhP97812 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IhhP97812 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IhhP97812 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
IhhP97812 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IhhP97812 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IhhP97812 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IhhP97812 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IhhP97812 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IhhP97812 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IhhP97812 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IhhP97812 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IhhP97812 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IhhP97812 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IhhP97812 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IhhP97812 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IhhP97812 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IhhP97812 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IhhP97812 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IhhP97812 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IhhP97812 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IhhP97812 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IhhP97812 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IhhP97812 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IhhP97812 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IhhP97812 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IhhP97812 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IhhP97812 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IhhP97812 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IhhP97812 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IhhP97812 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IhhP97812 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IhhP97812 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IhhP97812 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IhhP97812 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IhhP97812 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms