Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nbr1P97432 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nbr1P97432 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nbr1P97432 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nbr1P97432 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nbr1P97432 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nbr1P97432 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nbr1P97432 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nbr1P97432 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms