Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Irx3P81067 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Irx3P81067 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Irx3P81067 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Irx3P81067 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Irx3P81067 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Irx3P81067 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx3P81067 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Irx3P81067 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Irx3P81067 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Irx3P81067 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Irx3P81067 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Irx3P81067 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Irx3P81067 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Irx3P81067 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Irx3P81067 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Irx3P81067 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Irx3P81067 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Irx3P81067 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Irx3P81067 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Irx3P81067 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,3 ms