Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgf11P70378 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgf11P70378 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf11P70378 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf11P70378 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf11P70378 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fgf11P70378 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf11P70378 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms