Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SeboxP70368 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SeboxP70368 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeboxP70368 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeboxP70368 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeboxP70368 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SeboxP70368 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SeboxP70368 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SeboxP70368 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms