Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msx3P70354 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msx3P70354 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msx3P70354 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Msx3P70354 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx3P70354 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Msx3P70354 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msx3P70354 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx3P70354 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx3P70354 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msx3P70354 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Msx3P70354 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msx3P70354 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msx3P70354 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msx3P70354 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx3P70354 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx3P70354 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx3P70354 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msx3P70354 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msx3P70354 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msx3P70354 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msx3P70354 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msx3P70354 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx3P70354 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx3P70354 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx3P70354 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms