Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tuba1cP68373 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tuba1cP68373 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tuba1cP68373 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tuba1cP68373 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms