Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crnkl1P63154 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crnkl1P63154 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crnkl1P63154 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Crnkl1P63154 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crnkl1P63154 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crnkl1P63154 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crnkl1P63154 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crnkl1P63154 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crnkl1P63154 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms