Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps11P62281 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps11P62281 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps11P62281 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps11P62281 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps11P62281 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps11P62281 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps11P62281 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps11P62281 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps11P62281 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps11P62281 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps11P62281 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps11P62281 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps11P62281 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rps11P62281 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rps11P62281 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps11P62281 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps11P62281 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps11P62281 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps11P62281 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps11P62281 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps11P62281 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps11P62281 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps11P62281 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps11P62281 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps11P62281 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps11P62281 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps11P62281 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps11P62281 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps11P62281 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps11P62281 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps11P62281 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps11P62281 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps11P62281 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps11P62281 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps11P62281 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps11P62281 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1873 ms