Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psmc1P62192 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc1P62192 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmc1P62192 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc1P62192 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc1P62192 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psmc1P62192 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms