Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ActbP60710 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ActbP60710 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ActbP60710 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ActbP60710 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ActbP60710 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ActbP60710 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ActbP60710 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ActbP60710 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ActbP60710 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ActbP60710 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ActbP60710 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ActbP60710 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ActbP60710 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ActbP60710 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ActbP60710 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ActbP60710 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ActbP60710 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ActbP60710 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ActbP60710 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ActbP60710 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ActbP60710 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ActbP60710 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ActbP60710 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ActbP60710 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ActbP60710 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ActbP60710 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ActbP60710 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ActbP60710 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ActbP60710 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ActbP60710 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ActbP60710 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ActbP60710 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ActbP60710 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ActbP60710 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ActbP60710 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ActbP60710 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ActbP60710 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ActbP60710 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ActbP60710 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ActbP60710 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ActbP60710 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ActbP60710 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ActbP60710 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ActbP60710 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ActbP60710 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ActbP60710 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ActbP60710 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ActbP60710 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ActbP60710 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ActbP60710 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ActbP60710 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ActbP60710 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ActbP60710 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ActbP60710 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ActbP60710 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ActbP60710 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ActbP60710 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ActbP60710 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ActbP60710 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ActbP60710 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ActbP60710 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ActbP60710 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ActbP60710 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ActbP60710 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ActbP60710 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ActbP60710 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ActbP60710 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ActbP60710 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ActbP60710 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ActbP60710 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ActbP60710 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ActbP60710 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ActbP60710 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ActbP60710 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ActbP60710 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ActbP60710 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ActbP60710 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ActbP60710 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ActbP60710 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ActbP60710 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ActbP60710 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ActbP60710 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ActbP60710 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ActbP60710 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ActbP60710 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ActbP60710 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ActbP60710 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms