Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Romo1P60603 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Romo1P60603 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Romo1P60603 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Romo1P60603 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Romo1P60603 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Romo1P60603 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Romo1P60603 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms