Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfia3P60469 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia3P60469 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfia3P60469 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppfia3P60469 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia3P60469 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfia3P60469 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfia3P60469 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppfia3P60469 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms