Protein–RNA interactions for Protein: P59268

Zdhhc9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc9P59268 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zdhhc9P59268 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zdhhc9P59268 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdhhc9P59268 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zdhhc9P59268 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zdhhc9P59268 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdhhc9P59268 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zdhhc9P59268 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zdhhc9P59268 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zdhhc9P59268 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zdhhc9P59268 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdhhc9P59268 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdhhc9P59268 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms