Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ephb4P54761 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ephb4P54761 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ephb4P54761 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ephb4P54761 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ephb4P54761 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ephb4P54761 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ephb4P54761 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ephb4P54761 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ephb4P54761 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ephb4P54761 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ephb4P54761 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ephb4P54761 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms