Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Faf1P54731 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Faf1P54731 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Faf1P54731 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Faf1P54731 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Faf1P54731 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Faf1P54731 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Faf1P54731 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Faf1P54731 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Faf1P54731 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Faf1P54731 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Faf1P54731 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Faf1P54731 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Faf1P54731 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Faf1P54731 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Faf1P54731 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms