Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa10P50708 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa10P50708 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa10P50708 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defa10P50708 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa10P50708 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa10P50708 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa10P50708 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa10P50708 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa10P50708 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms