Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LtbrP50284 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LtbrP50284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LtbrP50284 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LtbrP50284 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LtbrP50284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LtbrP50284 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LtbrP50284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtbrP50284 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LtbrP50284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LtbrP50284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LtbrP50284 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LtbrP50284 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LtbrP50284 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LtbrP50284 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms