Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rph3aP47708 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rph3aP47708 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rph3aP47708 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rph3aP47708 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rph3aP47708 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rph3aP47708 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rph3aP47708 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms