Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv1P41164 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv1P41164 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv1P41164 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv1P41164 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Etv1P41164 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv1P41164 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Etv1P41164 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Etv1P41164 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv1P41164 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Etv1P41164 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv1P41164 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Etv1P41164 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv1P41164 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Etv1P41164 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Etv1P41164 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms