Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl28P41105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl28P41105 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl28P41105 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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