Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpn12P35831 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ptpn12P35831 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn12P35831 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptpn12P35831 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ptpn12P35831 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ptpn12P35831 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn12P35831 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn12P35831 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn12P35831 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn12P35831 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn12P35831 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms