Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apoc1P34928 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoc1P34928 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc1P34928 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc1P34928 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoc1P34928 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms