Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfap2aP34056 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfap2aP34056 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tfap2aP34056 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfap2aP34056 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfap2aP34056 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfap2aP34056 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfap2aP34056 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfap2aP34056 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms