Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nedd8P29595 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd8P29595 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nedd8P29595 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nedd8P29595 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd8P29595 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms