Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mep1aP28825 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mep1aP28825 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mep1aP28825 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mep1aP28825 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mep1aP28825 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mep1aP28825 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms