Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Htr1bP28334 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr1bP28334 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr1bP28334 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1bP28334 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htr1bP28334 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr1bP28334 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr1bP28334 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms