Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17,18■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,34
Defa3P28310 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Defa3P28310 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17,08■□□□□ 0,33
Defa3P28310 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Defa3P28310 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Defa3P28310 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa3P28310 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defa3P28310 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Defa3P28310 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms