Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SarsP26638 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SarsP26638 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SarsP26638 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SarsP26638 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SarsP26638 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SarsP26638 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SarsP26638 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SarsP26638 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SarsP26638 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SarsP26638 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SarsP26638 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SarsP26638 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SarsP26638 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SarsP26638 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SarsP26638 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SarsP26638 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SarsP26638 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SarsP26638 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SarsP26638 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SarsP26638 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SarsP26638 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SarsP26638 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SarsP26638 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SarsP26638 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SarsP26638 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SarsP26638 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SarsP26638 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SarsP26638 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SarsP26638 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SarsP26638 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SarsP26638 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SarsP26638 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SarsP26638 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SarsP26638 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SarsP26638 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SarsP26638 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SarsP26638 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SarsP26638 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SarsP26638 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SarsP26638 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SarsP26638 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SarsP26638 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SarsP26638 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SarsP26638 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SarsP26638 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SarsP26638 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SarsP26638 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SarsP26638 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SarsP26638 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SarsP26638 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SarsP26638 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SarsP26638 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SarsP26638 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SarsP26638 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SarsP26638 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SarsP26638 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SarsP26638 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SarsP26638 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SarsP26638 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SarsP26638 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SarsP26638 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SarsP26638 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SarsP26638 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SarsP26638 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SarsP26638 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SarsP26638 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SarsP26638 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SarsP26638 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SarsP26638 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SarsP26638 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SarsP26638 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SarsP26638 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SarsP26638 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SarsP26638 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SarsP26638 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SarsP26638 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SarsP26638 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SarsP26638 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SarsP26638 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SarsP26638 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SarsP26638 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SarsP26638 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SarsP26638 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SarsP26638 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SarsP26638 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SarsP26638 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SarsP26638 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SarsP26638 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SarsP26638 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SarsP26638 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SarsP26638 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SarsP26638 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SarsP26638 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SarsP26638 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SarsP26638 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SarsP26638 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SarsP26638 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SarsP26638 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SarsP26638 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms