Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gria2P23819 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria2P23819 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria2P23819 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria2P23819 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria2P23819 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria2P23819 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria2P23819 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria2P23819 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria2P23819 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gria2P23819 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria2P23819 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria2P23819 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria2P23819 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria2P23819 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria2P23819 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gria2P23819 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gria2P23819 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gria2P23819 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria2P23819 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria2P23819 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms