Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HdcP23738 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HdcP23738 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HdcP23738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HdcP23738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HdcP23738 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HdcP23738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HdcP23738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HdcP23738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HdcP23738 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HdcP23738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HdcP23738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HdcP23738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HdcP23738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HdcP23738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HdcP23738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HdcP23738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HdcP23738 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HdcP23738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HdcP23738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HdcP23738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HdcP23738 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HdcP23738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HdcP23738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HdcP23738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HdcP23738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HdcP23738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HdcP23738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HdcP23738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HdcP23738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HdcP23738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HdcP23738 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HdcP23738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms