Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ChrneP20782 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrneP20782 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrneP20782 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrneP20782 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChrneP20782 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChrneP20782 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrneP20782 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChrneP20782 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrneP20782 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrneP20782 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChrneP20782 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrneP20782 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrneP20782 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChrneP20782 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChrneP20782 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChrneP20782 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChrneP20782 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChrneP20782 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms