Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn1P18608 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgn1P18608 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmgn1P18608 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn1P18608 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn1P18608 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn1P18608 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmgn1P18608 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms