Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GhrP16882 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhrP16882 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GhrP16882 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
GhrP16882 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GhrP16882 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhrP16882 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhrP16882 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GhrP16882 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhrP16882 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhrP16882 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GhrP16882 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GhrP16882 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhrP16882 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhrP16882 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhrP16882 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhrP16882 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GhrP16882 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhrP16882 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhrP16882 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhrP16882 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhrP16882 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GhrP16882 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhrP16882 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhrP16882 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhrP16882 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhrP16882 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GhrP16882 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GhrP16882 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhrP16882 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GhrP16882 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GhrP16882 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhrP16882 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhrP16882 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GhrP16882 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GhrP16882 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GhrP16882 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GhrP16882 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhrP16882 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhrP16882 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhrP16882 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhrP16882 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GhrP16882 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhrP16882 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhrP16882 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GhrP16882 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhrP16882 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GhrP16882 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GhrP16882 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GhrP16882 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GhrP16882 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GhrP16882 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GhrP16882 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhrP16882 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhrP16882 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GhrP16882 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhrP16882 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhrP16882 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GhrP16882 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhrP16882 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhrP16882 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GhrP16882 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhrP16882 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GhrP16882 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhrP16882 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhrP16882 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhrP16882 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GhrP16882 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GhrP16882 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GhrP16882 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhrP16882 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhrP16882 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GhrP16882 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GhrP16882 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GhrP16882 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GhrP16882 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhrP16882 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GhrP16882 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhrP16882 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhrP16882 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GhrP16882 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhrP16882 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GhrP16882 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhrP16882 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhrP16882 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhrP16882 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GhrP16882 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GhrP16882 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhrP16882 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GhrP16882 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhrP16882 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhrP16882 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhrP16882 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GhrP16882 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhrP16882 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhrP16882 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GhrP16882 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GhrP16882 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GhrP16882 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GhrP16882 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.8 ms