Protein–RNA interactions for Protein: P16872

Il7r, Interleukin-7 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il7rP16872 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il7rP16872 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il7rP16872 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Il7rP16872 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il7rP16872 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il7rP16872 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il7rP16872 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Il7rP16872 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il7rP16872 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il7rP16872 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il7rP16872 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il7rP16872 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il7rP16872 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il7rP16872 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Il7rP16872 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il7rP16872 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il7rP16872 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il7rP16872 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il7rP16872 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il7rP16872 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il7rP16872 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Il7rP16872 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il7rP16872 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il7rP16872 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Il7rP16872 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il7rP16872 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il7rP16872 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il7rP16872 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il7rP16872 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il7rP16872 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il7rP16872 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms