Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rplp0P14869 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rplp0P14869 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rplp0P14869 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rplp0P14869 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rplp0P14869 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rplp0P14869 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rplp0P14869 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rplp0P14869 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rplp0P14869 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms