Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1P13405 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1P13405 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rb1P13405 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1P13405 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1P13405 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1P13405 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rb1P13405 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1P13405 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1P13405 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1P13405 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1P13405 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1P13405 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1P13405 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1P13405 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rb1P13405 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1P13405 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1P13405 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1P13405 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms