Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrm1P12657 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrm1P12657 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrm1P12657 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrm1P12657 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrm1P12657 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrm1P12657 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrm1P12657 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms